Ein besonderes Problem der stofflichen Verschmutzung von Gewässern sind Mischwasserüberläufe. Hier wird die Verschmutzung durch häusliche und industrielle Abwässer zum Regenwasser hinzugefügt und vermischt. Dies geschieht, um den Abfluss zur Kläranlage bei Spitzenabflüssen zu verringern, wenn aus technischen und wasserwirtschaftlichen Gründen keine zusätzlichen Kapazitäten vorhanden sind. Das bedeutet jedoch, dass das vermischte Abwasser unbehandelt in Oberflächen-Gewässer wie Seen und Flüsse gelangen kann.
Die zuständige Behörde ist in der Lage höhere Anforderungen zu formulieren mit dem Ziel, die Zahl der Mischwasserüberlauf-Ereignisse zu reduzieren.